臺南是黑面琵鷺在臺灣最主要的停棲地點，於曾文溪口及四草野生動物保護區、學甲及北門濕地等區域皆可見黑琵族群停棲覓食，臺南已成為黑面琵鷺在臺灣最大的棲息覓食場所，更代表臺南在棲地的環境優化的努力逐漸顯現。內政部國家公園署辦理110、111及112年度濕地保育補助評鑑表現亮眼，共獲1案特優及8案優等，這是公部門單位及民間團體多年來共同合作努力成果。
為提升野鳥救護應變能力，降低來臺度冬黑面琵鷺傷亡數量，自民國93年開始，每年皆邀集林業及自然保育署、生物多樣性研究所、台江國家公園管理處及各保育團體於候鳥季進行「黑面琵鷺大量鳥類傷患救援演習」，確實精進野鳥救護實務經驗，強化各相關單位配合聯繫默契；此外，自110年度起本市及配合林業及自然保育署，持續推動瀕危物種及重要棲地生態服務給付，在七股、安南地區的陸上魚塭為黑面琵鷺營造更多友善的覓食棲息環境。
外傳本市黑面琵鷺受光電裝置影響，致臺南度冬之黑面琵鷺數量下降。農業局表示：內政部國家公園署台江國家公園管理處公布1月19日台南所記錄到的數量為2536隻，與113年1月22日紀錄之1849隻相比，數量有所提升。臺南市轄內依據濕地保育法劃設的重要濕地範圍內均無設置光電設施，若於重要濕地或其保育利用計畫範圍內，發生破壞或干擾濕地環境生態等行為，將依濕地保育法進行裁罰，就目前觀察，黑面琵鷺數量未因光電設施影響，本局將持續觀注後續調查數據。
未來將持續進行黑面琵鷺棲地保育營造，並呼籲各界共同守護珍貴的濕地環境，一起落實關心黑面琵鷺保育行動。更希望民眾在欣賞候鳥優美姿態的同時，也能為黑面琵鷺保育盡力，幫一年一度來臺的嬌客營造更友善的度冬環境。
